国内外期刊的组织机构和论文的评审过程大体上相似。通常每个期刊都由该领域比较有名望的科学家担任主编（editor-in-chief） ，有的还设副主编。同时还有一个由多名学者组成的编委会（editorial board） 。这些人员参与期刊工作通常是义务性的、无报酬的。一个期刊都有数名专职编辑（managing editor）组成期刊编辑部（joumal department），负责处理日常工作。有些刊物如Nature 不设由资深科学家组成的编委会，该刊认为这样可避免某些编委会成员因学术观点或种族偏见在决定稿件取舍时受到的影响。
论文稿寄到编辑部，通常由专职编辑初步预审。在这一步将有以下几种抉择：
①文稿不属于该刊所覆盖的范围，退还给作者。说明作者选择杂志不对，应该改投其他杂志。
②文稿书写体例不符合稿约，或材料不完备，此时通常也是退还作者c 作者按稿约重写或将材料准备齐全后还可再寄回该刊。
③ 文稿题材及书写体例等均符合该刊要求，即给予登记编号，由主编或编辑决定交专业对口的评阅人（审稿员）评阅。同时给作者寄回一张附有稿件编号的收条，或明信片，以便查询。如果过了中6 周都没有回音，作者有理由向编辑部询问。
通常一份文稿要有两位评阅人进行同行评阅（peer review） 。评阅人首先从编委会成员中物色，常常还要找编委会之外的专家，即特约评阅人（ad hoc reviewer）或者叫编辑顾问（editorial consultants） 。各杂志编辅部在给评阅人寄稿件时都要附上一份评稿指南（guidelinesfor manuscript review）和评审表。指南中通常要求评阅人就以下一些问题提出意见：①论文是否适合在本刊发表？②是否给文章所属领域增加了新知识？③实验设计、方法和结果是否表述清楚、切实可靠？④从所提供的材料中是否能合乎逻辑地导出作者的结论？⑤所引参考文献是否新颖和贴切？⑥文中的图和表在质量和数目上是否适当？评阅人除写出书面意见之外，应按评审表中列出的接受（accept） 、需修改（mod均）和拒绝（reject）三者提出明确建议。
对稿件的作者来说，评阅人的姓名是保密的，评阅是”背对背”的。评阅人只是提出建议（recommendation），决定由主编来做。如两名评阅人意见一致，主编的决心容易下定。如两名评阅人意见不一致，主编可根据自己的知识和经验做决定；也可以送给另外的评阅人评阅后再定。”背对背”评阅，是把好杂志质量关的重要一环。
